Pipelines
| Pipeline Name | Released | Released after tools | Main = release | JSON Schema | DSL2 | Wikis | Issues | Merge commits | Rebase merging | Squash merges | Default branch | Keywords | Description | Repo URL | Team access | Branches exist | Branch protection: main | Branch protection: dev | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ascc | |||||||||||||||||||||||||||||||
| blobtoolkit | |||||||||||||||||||||||||||||||
| curationpretext | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ear | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ensemblgenedownload | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ensemblrepeatdownload | |||||||||||||||||||||||||||||||
| genealignment | — | — | |||||||||||||||||||||||||||||
| genomeassembly | — | — | |||||||||||||||||||||||||||||
| genomenote | |||||||||||||||||||||||||||||||
| insdcdownload | |||||||||||||||||||||||||||||||
| metagenomeassembly | |||||||||||||||||||||||||||||||
| readmapping | |||||||||||||||||||||||||||||||
| sequencecomposition | |||||||||||||||||||||||||||||||
| treeval | |||||||||||||||||||||||||||||||
| variantcalling | |||||||||||||||||||||||||||||||
| zippypretext | — | — | |||||||||||||||||||||||||||||
Core repos
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